ImageJ数值化色谱图绘制教程

EndNote教程 2024-02-15

图像具有一定的灰度数值，利用这个属性我们可以将实验图片进行数值化，进而进行可视化，达到定性和定量的相结合，将其应用在论文中是一个不错的选择。

下图是一张色谱条带

我们需要将其做成下面的图形放在论文中，该怎么弄呢，赶紧来学学的吧！

软件

FIJI 或ImageJ软件，Origin2019b软件

数据提取

1. 使用FIJI打开图片（直接拖拽进去即可），这里我使用的是原始图

2. 我们选择第一条条带进行演示，使用矩形工具进行框选择第一条条带,点击菜单栏-Image-Crop，进行裁剪

3. 点击左上角File-Save as另存为图片备用

4. 使用直线工具画一条直线在条带上,然后双击直线工具，可以将线条调整的粗一点

5. 点击直线分析,Analyze-Plot Profile

6. 在这里就会出现一张类似的色谱曲线图，其中左下角会有一些参数。点击List,就会出现图形的对应的数据，点击Data你可以将数据保存在csv格式的文件中，点击more你可以对横纵坐标进行设置。这里，我们将数据保存在csv文件中，以方便日后使用。

软件作图

1. 使用Origin进行作图，将上述数据复制进来，写好纵坐标，横坐标是像素值，我们就不显示了

2. 通过一系列基础设置就如下所示

3. 进行导出图即可

一键组图

1. 使用AI/PS/Origin/PPT软件，进行组图，然后导出图片即可